Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85AQ96PX6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms