Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
JSRP1Q96MG2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms