Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms