Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EP400Q96L91 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms