Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP47Q96K76 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms