Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRIQ1Q96JM4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
LRRIQ1Q96JM4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms