Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms