Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC12Q96J65 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms