Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms