Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCMH1Q96GD3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCMH1Q96GD3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCMH1Q96GD3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCMH1Q96GD3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCMH1Q96GD3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCMH1Q96GD3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCMH1Q96GD3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCMH1Q96GD3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCMH1Q96GD3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCMH1Q96GD3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms