Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms