Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNFT2Q96EX2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms