Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUS1Q96E22 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms