Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM4SF19Q96DZ7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM4SF19Q96DZ7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms