Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC39Q96DD0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms