Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NXNL1Q96CM4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms