Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms