Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms