Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTSSAQ969W0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms