Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms