Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD50Q92878 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD50Q92878 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms