Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX38Q92620 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHX38Q92620 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms