Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms