Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRSF12Q8WXF0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms