Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PHIPQ8WWQ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms