Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms