Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29Q8TEQ0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29Q8TEQ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms