Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSH3Q8TE77 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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