Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNPDA2Q8TDQ7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms