Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL2Q8NHH9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms