Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC148Q8NFR7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms