Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms