Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC2Q8NBF2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC2Q8NBF2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms