Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms