Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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