Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms