Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms