Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CATSPER4Q7RTX7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPER4Q7RTX7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms