Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms