Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP31Q70CQ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP31Q70CQ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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