Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms