Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
SRCAPQ6ZRS2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms