Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ASCL4Q6XD76 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL4Q6XD76 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms