Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINGO4Q6UY18 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms