Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL17Q6UXB2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCL17Q6UXB2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms