Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF2Q6PJF5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF2Q6PJF5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF2Q6PJF5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF2Q6PJF5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF2Q6PJF5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDF2Q6PJF5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDF2Q6PJF5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms