Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRNP1Q6NT89 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms