Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCSD1Q6JBY9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms