Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DIPQ5VU43 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms