Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOGA3Q5TF21 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms